本所課程設計提供完整的基礎課程給予學生必備的薰陶， 以及多元的選修課程讓學生有廣博的接觸， 並發展其適合的研究方向，以進一步與指導教授進行研究。 基礎課程包括恆星天文物理學，星系天文學，天文觀測，與天文輻射物理。 各項選修課程包括星際介質，宇宙論，電波天文學，高能天文物理等等。 本所同時在物理系大學部開設多門天文課程，包括普通天文學，基礎天文觀測， 天文物理導論等等，以提供一個完整的大學部基礎天文學學程。

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本所課程皆以英文授課。